Rintasyövän sähköisen oire- ja vasteseurannan tutkimus (FINBCC2)
Päärahoittaja
Rahoittajan antama koodi/diaarinumero: 464706
Päärahoittajan myöntämä tuki (€)
- 36 400,00
Rahoitusohjelma
Hankkeen aikataulu
Hankkeen aloituspäivämäärä: 01.01.2023
Hankkeen päättymispäivämäärä: 31.03.2023
Tiivistelmä
Rintasyöpä on naisten yleisimmin diagnosoitu syöpä ja johtava kuolinsyy maailmanlaajuisesti. Rintasyöpä on sairautena erittäin heterogeeninen niin patologisten ja molekulaaristen ominaisuuksien, ennusteen ja myös hoitovasteen suhteen. 15–20 %:ssa tapauksista kasvaimissa voidaan havaita HER2-geenin yli-ilmentymistä. Koska HER2 on voimakas (proto)onkogeeni, nämä kasvaimet käyttäytyvät aggressiivisemmin kuin HER2-negatiiviset rintasyövät. Tällä hetkellä erittäin pieniä HER2-pitoisuuksia sisältävien näytteiden analysointiin ei ole olemassa selkeää standardimenetelmää, ja uuden ”ultra-low” -määritelmän myötä tehtävien analyysien määrä ja tarkkuus tulevat jatkossa asettamaan uusia haasteita patologisten näytteiden käsittelyissä ja analyysien toteutuksessa. Tutkimuksen tarkoituksena on selvittää ”ultra low” HER2-pitoisuuksia sisältävien näytteiden osuutta koko rintasyöpäpopulaatiossa. Potilaat valikoituvat hoitoon nykyisten kliinisten hoitosuositusten mukaisesti, mutta hoitovasteita, potilaiden näkökulmaa ja elämänlaatua sekä oireita mitataan ja seurataan digitaalisen sovelluksen avulla. Tätä tietoa hyödynnetään uuden diagnostiikan hyödyntämisen aikapisteen määrittämiseksi, ja tarpeen mukaan käytetään hoidon ohjaukseen ja potilaiden osallistamiseen oman hoitonsa toteutukseen. Oiremuutosten aikapisteissä potilailta kerätyistä näytteistä eristetään syöpäkasvaimien ja rintasyövän lääkehoitoon käytettyjen molekyylien metaboliitteja ja rakenteita, joiden avulla tarkastellaan syövän elimistössä toteuttamia kemiallisia reaktioita. Kemiallisten reaktioiden ymmärryksen kautta voidaan lääkehoitoa tarpeen mukaan ohjata ja muuttaa, ja samalla kasvattaa ymmärrystä minkälaista kemiaa syöpäkasvaimet käyttävät kasvumekanismeissa ja mutaatioissa. Kemialliset reaktiot määrittämällä voidaan ymmärtää minkälaisia rakenteita molekyyleissä tulisi käyttää kasvun ja mutaatioiden estämiseksi, ja kasvattaa ymmärrystä syöpäkasvaimet hyödyntävät taudin edetessä ja minkälaisia kemiallisia reaktioita kasvun yhteydessä tapahtuu. Näitä ilmiöitä on tutkittu toistaiseksi verrattain vähän, mutta niiden avulla voidaan tuoda tarkin mahdollinen, yksittäisten funktionaalisten ryhmien, sidosten ja molekyylitason ymmärrys syövän kasvusta. Näin ollen ei tarvitsisi turvautua pelkästään molekyylibiologisiin tai kliinisiin tarkastelumenetelmiin, jotka jättävät informaatioon aukkoja.
Lisäksi tutkimuksessa hyödynnetään koneoppimista ”ultra low” -potilaiden patologianäytteiden analysoimisen automatisoinnissa ja helpottamisessa tulevaisuutta ajatellen.
Lisäksi tutkimuksessa hyödynnetään koneoppimista ”ultra low” -potilaiden patologianäytteiden analysoimisen automatisoinnissa ja helpottamisessa tulevaisuutta ajatellen.
