Fytokromipohjaiset moduulit – toiminta ja sovellukset

Päärahoittaja

Rahoittajan antama koodi/diaarinumero: 330678

Päärahoittajan myöntämä tuki (€)

Rahoitusohjelma

Hankkeen aikataulu

Hankkeen aloituspäivämäärä: 01.09.2020

Hankkeen päättymispäivämäärä: 31.08.2025

Tiivistelmä

Proteiinit koostuvat alayksiköistä, joiden toimintaa on usein vaikea tutkia ja kontrolloida. Optogenetiikka on tieteenala, jossa solujen ja proteiinien toimintaa ohjaillaan valon avulla. Se perustuu valoa aistiviin proteiineihin, valoreseptoreihin, joista muokataan geneettisesti työkaluja. Nämä optogeneettiset työkalut aistivat valoa normaalisti, mutta reagoivat siihen uudella tavalla. Tässä projektissa FT Heikki Takala tutkii bakteerien fytokromeja. Näissä punaista valoa aistivissa valoreseptoreissa on ominaisuuksia, jotka soveltuvat optogenetiikkaan muita valoreseptoreja paremmin. Niistä voidaankin valmistaa entistä parempia työkaluja tutkimus- ja terapiakäyttöön. Yksi näistä työkaluista on CRISPR-Cas9, jolla voi muokata kohdesolun DNA:ta punaisen valon avulla. Takala on aikaisemmin selvittänyt, millaisia rakenteellisia muutoksia fytokromeissa tapahtuu valon vaikutuksesta. Nyt hän aikookin syventää tätä ymmärrystä ja löytää uusia fytokromipohjaisia sovelluksia Jyväskylän yliopistossa

Vastuullinen johtaja

Päävastuullinen yksikkö

Liittyvät julkaisut ja muut tuotokset

  

  

  

1/2

  

  

  

• Multimodal Control of Bacterial Gene Expression by Red and Blue Light (2024) Meier, Stefanie S. M.; et al.; A3; 978-1-0716-3658-9
• The interconnecting hairpin extension "arm" : An essential allosteric element of phytochrome activity (2023) Kurttila, Moona; et al.; A1; OA
• Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome (2022) Lehtivuori, Heli; et al.; A1; OA
• Optogenetic Control of Bacterial Expression by Red Light (2022) Multamäki, Elina; et al.; A1; OA
• Red Light Optogenetics in Neuroscience (2022) Lehtinen, Kimmo; et al.; A2; OA
• Structural mechanism of signal transduction in a phytochrome histidine kinase (2022) Wahlgren, Weixiao Yuan; et al.; A1; OA
• The structural effect between the output module and chromophore-binding domain is a two-way street via the hairpin extension (2022) Kurttila, Moona; et al.; A1; OA
• Comparative analysis of two paradigm bacteriophytochromes reveals opposite functionalities in two-component signaling (2021) Multamäki, Elina; et al.; A1; OA
• Site-by-site tracking of signal transduction in an azidophenylalanine-labeled bacteriophytochrome with step-scan FTIR spectroscopy (2021) Kurttila, Moona; et al.; A1; OA
• The hairpin extension controls solvent access to the chromophore binding pocket in a bacterial phytochrome : a UV–vis absorption spectroscopy study (2021) Rumfeldt, Jessica; et al.; A1; OA