A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Structure of SNX9 SH3 in complex with a viral ligand reveals the molecular basis of its unique specificity for alanine-containing class I SH3 motifs (2022)
Tossavainen, H., Uğurlu, H., Karjalainen, M., Hellman, M., Antenucci, L., Fagerlund, R., Saksela, K., & Permi, P. (2022). Structure of SNX9 SH3 in complex with a viral ligand reveals the molecular basis of its unique specificity for alanine-containing class I SH3 motifs. Structure, 30(6), 828-839.e6. https://doi.org/10.1016/j.str.2022.03.006
JYU-tekijät tai -toimittajat
Julkaisun tiedot
Julkaisun kaikki tekijät tai toimittajat: Tossavainen, Helena; Uğurlu, Hasan; Karjalainen, Mikael; Hellman, Maarit; Antenucci, Lina; Fagerlund, Riku; Saksela, Kalle; Permi, Perttu
Lehti tai sarja: Structure
ISSN: 0969-2126
eISSN: 1878-4186
Julkaisuvuosi: 2022
Ilmestymispäivä: 06.04.2022
Volyymi: 30
Lehden numero: 6
Artikkelin sivunumerot: 828-839.e6
Kustantaja: Elsevier
Julkaisumaa: Alankomaat
Julkaisun kieli: englanti
DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2022.03.006
Julkaisun avoin saatavuus: Avoimesti saatavilla
Julkaisukanavan avoin saatavuus: Osittain avoin julkaisukanava
Julkaisu on rinnakkaistallennettu (JYX): https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/80830
Tiivistelmä
Class I SH3 domain-binding motifs generally comply with the consensus sequence [R/K]xØPxxP, the hydrophobic residue Ø being proline or leucine. We have studied the unusual Ø = Ala-specificity of SNX9 SH3 by determining its complex structure with a peptide present in eastern equine encephalitis virus (EEEV) nsP3. The structure revealed the length and composition of the n-Src loop as important factors determining specificity. We also compared the affinities of EEEV nsP3 peptide, its mutants, and cellular ligands to SNX9 SH3. These data suggest that nsP3 has evolved to minimize reduction of conformational entropy upon binding, hence acquiring stronger affinity, enabling takeover of SNX9. The RxAPxxP motif was also found in human T cell leukemia virus-1 (HTLV-1) Gag polyprotein. We found that this motif was required for efficient HTLV-1 infection, and that the specificity of SNX9 SH3 for the RxAPxxP core binding motif was importantly involved in this process.
YSO-asiasanat: proteiinit; soluviestintä; virukset; alfavirukset; retrovirukset
Vapaat asiasanat: EEEV nsP3; HTLV-1 Gag; isothermal titration calorimetry; SH3; SNX9; solution NMR spectroscopy
Liittyvät organisaatiot
Hankkeet, joissa julkaisu on tehty
- Peptidoglykaanihydrolaasit vastaan antibioottiresistentti Staphylococcus aureus
- Permi, Perttu
- Suomen Akatemia
OKM-raportointi: Kyllä
Raportointivuosi: 2022
JUFO-taso: 2
