A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome (2022)
Lehtivuori, H., Rumfeldt, J., Mustalahti, S., Kurkinen, S., & Takala, H. (2022). Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome. Photochemical and Photobiological Sciences, 21(11), 1975-1989. https://doi.org/10.1007/s43630-022-00272-6
JYU-tekijät tai -toimittajat
Julkaisun tiedot
Julkaisun kaikki tekijät tai toimittajat: Lehtivuori, Heli; Rumfeldt, Jessica; Mustalahti, Satu; Kurkinen, Sami; Takala, Heikki
Lehti tai sarja: Photochemical and Photobiological Sciences
ISSN: 1474-905X
eISSN: 1474-9092
Julkaisuvuosi: 2022
Ilmestymispäivä: 29.07.2022
Volyymi: 21
Lehden numero: 11
Artikkelin sivunumerot: 1975-1989
Kustantaja: Springer Science and Business Media LLC
Julkaisumaa: Saksa
Julkaisun kieli: englanti
DOI: https://doi.org/10.1007/s43630-022-00272-6
Julkaisun avoin saatavuus: Avoimesti saatavilla
Julkaisukanavan avoin saatavuus: Osittain avoin julkaisukanava
Julkaisu on rinnakkaistallennettu (JYX): https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/82490
Tiivistelmä
Phytochromes are red light-sensing photoreceptor proteins that bind a bilin chromophore. Here, we investigate the role of a conserved histidine (H260) and tyrosine (Y263) in the chromophore-binding domain (CBD) of Deinococcus radiodurans phytochrome (DrBphP). Using crystallography, we show that in the H260A variant, the missing imidazole side chain leads to increased water content in the binding pocket. On the other hand, Y263F mutation reduces the water occupancy around the chromophore. Together, these changes in water coordination alter the protonation and spectroscopic properties of the biliverdin. These results pinpoint the importance of this conserved histidine and tyrosine, and the related water network, for the function and applications of phytochromes.
YSO-asiasanat: bakteerit; proteiinit; säteily; valo; valokemia; fotobiologia; spektroskopia; kidetiede
Vapaat asiasanat: fytokromit
Liittyvät organisaatiot
Hankkeet, joissa julkaisu on tehty
- Fytokromipohjaiset moduulit – toiminta ja sovellukset
- Takala, Heikki
- Suomen Akatemia
- Valokytkeytyvien proteiinien primaarirea
- Lehtivuori, Heli
- Suomen Akatemia
- Molekyylin kemian ohjaaminen pintaplasmonien avulla
- Groenhof, Gerrit
- Suomen Akatemia
OKM-raportointi: Kyllä
Raportointivuosi: 2022
Alustava JUFO-taso: 1