A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Methylation status of VTRNA2-1/nc886 is stable across populations, monozygotic twin pairs and in majority of tissues (2022)


Marttila, S., Tamminen, H., Rajić, S., Mishra, P. P., Lehtimäki, T., Raitakari, O., Kähönen, M., Kananen, L., Jylhävä, J., Hägg, S., Delerue, T., Peters, A., Waldenberger, M., Kleber, M. E., März, W., Luoto, R., Raitanen, J., Sillanpää, E., Laakkonen, E. K., . . . Raitoharju, E. (2022). Methylation status of VTRNA2-1/nc886 is stable across populations, monozygotic twin pairs and in majority of tissues. Epigenomics, 14(18), 1105-1124. https://doi.org/10.2217/epi-2022-0228


JYU-tekijät tai -toimittajat


Julkaisun tiedot

Julkaisun kaikki tekijät tai toimittajat: Marttila, Saara; Tamminen, Hely; Rajić, Sonja; Mishra, Pashupati P; Lehtimäki, Terho; Raitakari, Olli; Kähönen, Mika; Kananen, Laura; Jylhävä, Juulia; Hägg, Sara; et al.

Lehti tai sarja: Epigenomics

ISSN: 1750-1911

eISSN: 1750-192X

Julkaisuvuosi: 2022

Ilmestymispäivä: 05.10.2022

Volyymi: 14

Lehden numero: 18

Artikkelin sivunumerot: 1105-1124

Kustantaja: Future Medicine

Julkaisumaa: Britannia

Julkaisun kieli: englanti

DOI: https://doi.org/10.2217/epi-2022-0228

Julkaisun avoin saatavuus: Avoimesti saatavilla

Julkaisukanavan avoin saatavuus: Osittain avoin julkaisukanava

Julkaisu on rinnakkaistallennettu (JYX): https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/83586


Tiivistelmä

Aims & methods: The aim of this study was to characterize the methylation level of a polymorphically imprinted gene, VTRNA2-1/nc886, in human populations and somatic tissues.48 datasets, consisting of more than 30 tissues and >30,000 individuals, were used.
Results:nc886 methylation status is associated with twin status and ethnic background, but the variation between populations is limited. Monozygotic twin pairs present concordant methylation, whereas ∼30% of dizygotic twin pairs present discordant methylation in the nc886 locus. The methylation levels of nc886 are uniform across somatic tissues, except in cerebellum and skeletal muscle.
Conclusion: The nc886 imprint may be established in the oocyte, and, after implantation, the methylation status is stable, excluding a few specific tissues.


YSO-asiasanat: geenit; geeniekspressio; DNA-metylaatio; väestötutkimus

Vapaat asiasanat: developmental origins of health and disease hypothesis; DNA methylation; imprinting; metastable epiallele; polymorphic imprinting; population studies


Liittyvät organisaatiot


OKM-raportointi: Kyllä

Raportointivuosi: 2022

JUFO-taso: 1


Viimeisin päivitys 2024-03-04 klo 17:26