G5 Artikkeliväitöskirja
Cities and their effects on free-living and host-associated microbes (2023)
Kaupungit ja niiden vaikutukset vapaasti eläviin ja isäntään liittyviin mikrobeihin

Scholier, T. (2023). Cities and their effects on free-living and host-associated microbes [Doctoral dissertation]. University of Jyväskylä. JYU dissertations, 677. http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-39-9699-4

JYU-tekijät tai -toimittajat

Julkaisun tiedot

Julkaisun kaikki tekijät tai toimittajat: Scholier, Tiffany

eISBN: 978-951-39-9699-4

Lehti tai sarja: JYU dissertations

eISSN: 2489-9003

Julkaisuvuosi: 2023

Sarjan numero: 677

Kirjan kokonaissivumäärä: 1 verkkoaineisto (45, 14 sivua, 3 numeroimatonta sivua)

Kustantaja: University of Jyväskylä

Julkaisumaa: Suomi

Julkaisun kieli: suomi

Pysyvä verkko-osoite: http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-39-9699-4

Julkaisun avoin saatavuus: Avoimesti saatavilla

Julkaisukanavan avoin saatavuus: Kokonaan avoin julkaisukanava

Tiivistelmä

Mikrobit ovat oleellisen tärkeitä elämälle maapallolla, ja niitä esiintyy vapaina ympäristössä tai isäntäorganismeissa tukien ekosysteemien ja/tai isäntien normaalia toimintaa. Ihminen vaikuttaa lähes kaikkiin planeettamme elinympäristöihin aiheuttaen niiden häviämistä ja huonontumista (mukaan lukien kaupunkien rakentaminen) sekä ympäristöjen saastumista ja ilmastonmuutosta. Mikrobiyhteisöjen (kutsutaan myös mikrobiotaksi, mukaan lukien bakteerit ja sienet) odotetaan reagoivan näihin ihmisen aiheuttamiin valintapaineisiin sopeutumalla muuttuvaan ympäristöön. Siten ihmisen aiheuttamat muutokset ympäristössä voivat muovata mikrobiyhteisöjä (sekä vapaasti eläviä että isäntiin liittyviä) muuttaen mikrobi-yhteisöjen vaikutuksia ekosysteemeissä ja isännissä. Väitöskirjassani tutkin ihmistoiminnan vaikutuksia ympäristössä vapaasti eläviin ja luonnonvaraisissa isäntäeläimissä esiintyviin mikrobiyhteisöihin käyttämällä erilaisia tutkimusasetelmia, mukaan lukien laaja-alaiset poikkileikkausaineistot ja kokeelliset työt sekä DNA-metaviivakoodaus ja isotooppianalyysit. Väitöskirjatyöni tavoitteena oli määrittää kuinka kaupungistuminen vaikuttaa (1) metsämaaperän ja (2) jyrsijöiden (metsämyyrän) suoliston bakteeri- ja sieniyhteisöihin. Lisäksi tarkastelin, kuinka (3) metsämyyrän suoliston mikrobiota säilyy muuttumattomana (resistenssi) tai muuttuu (plastisuus) vastaamaan uutta ympäristöä elinympäristön vaihtumisen jälkeen (isännän siirto kaupunkien ja maaseudun metsien välillä). Tulosteni perusteella molemmat, sekä 1) metsän maaperän mikrobisto, että 2) metsämyyrän suolistomikrobisto eroavat kaupunkimetsien ja kaupunkien ulkopuolisten metsien välillä. Erityisesti erot maaperän happamuudessa ja jyrsijöiden ruokavaliossa tunnistettiin tärkeiksi tekijöiksi maaperän ja metsämyyrän suolen mikrobiotan muovautumisessa. Lisäksi havaitsin, että elinympäristön muutosta edeltävä ympäristö (resistenssi) ja uusi ympäristö (plastisuus) vaikuttavat suoliston mikrobiotan koostumukseen luonnonvaraisessa jyrsijässä. Väitöskirjani tulokset osoittavat, että kaupunkiluonto vaikuttaa mikrobiyhteisöihin kahdessa eri järjestelmässä ja osoittavat täten kaupungistumisen kauaskantoiset vaikutukset mikrobien elämänmuotoihin.

YSO-asiasanat: mikrobit; mikrobisto; suolistomikrobisto; kaupungistuminen; ympäristövaikutukset; metsät; metsämaa; maaperä; metsämyyrä; väitöskirjat

Vapaat asiasanat: bacteria; fungi; gut microbiota; rodent; soil microbiota; urban; wildlife

Liittyvät organisaatiot

OKM-raportointi: Kyllä

VIRTA-lähetysvuosi: 2023