G5 Artikkeliväitöskirja
Extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae : risks during antibiotic treatment and potential solutions to cure carriage (2019)
Ruotsalainen, Pilvi (2019). Extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae : risks during antibiotic treatment and potential solutions to cure carriage. JYU dissertations, 107. Jyväskylä: Jyväskylän yliopisto. http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-39-7819-8
JYU-tekijät tai -toimittajat
Julkaisun tiedot
Julkaisun kaikki tekijät tai toimittajat: Ruotsalainen, Pilvi
eISBN: 978-951-39-7819-8
Lehti tai sarja: JYU dissertations
eISSN: 2489-9003
Julkaisuvuosi: 2019
Sarjan numero: 107
Kirjan kokonaissivumäärä: 1 verkkoaineisto (89 sivua, 28 sivua useina numerointijaksoina, 10 numeroimatonta sivua) :
Kustantaja: Jyväskylän yliopisto
Kustannuspaikka: Jyväskylä
Julkaisumaa: Suomi
Julkaisun kieli: englanti
Pysyvä verkko-osoite: http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-39-7819-8
Avoin saatavuus: Open access -julkaisukanavassa ilmestynyt julkaisu
Tiivistelmä
bakteerikantojen globaaliin kasvuun. Pääosin tämä johtuu moniresistenssi
plasmidien nopeasta leviämisestä bakteeriyhteisössä konjugaation avulla.
Lisäksi laajakirjoisia β-laktamaaseja (ESBL) tuottavien enterobakteerien
yleistyminen ihmisten suoliston normaalifloorassa mahdollistaa konjugatiivisten
ESBL-plasmidien leviämisen uusiin bakteeri-isäntiin. Kontrolloidaksemme
näiden plasmidien leviämistä, on tärkeää selvittää tekijöitä, jotka vaikuttavat
leviämiseen. Tässä väitöskirjassa esitän, kuinka bakteerit voivat evolutiivisesti
pelastaa bakteeriyhteisön antibiooteille alttiit bakteerit jopa letaalissa β-laktaami
konsentraatiossa konjugoimalla ESBL-plasmidin näihin soluihin. Näin ollen jopa
tehokas antibioottihoito ei välttämättä estä antibioottisensitiivisten patogeenien
muuntumista resistenteiksi. Lisäksi näytän, kuinka kehittämäni geenisaksia
(CRISPR-Cas9) koodaava konjugatiivinen plasmidisysteemi (nim. midbiotic)
tuhoaa sekvenssispesifisesti erilaisia ESBL-plasmideja bakteeriyhteisöstä.
Yhdellä plasmidilla pystytään kohdentamaan useita eri resistenssigeenejä
samanaikaisesti ja lopputuloksena bakteerit muuntuvat jälleen alttiiksi βlaktaameille. Tätä menetelmää voisi hyödyntää esimerkiksi hävittämään
resistenssigeenejä suolistofloorasta. Ennen midbioticin käyttöönottoa in vivo,
menetelmää tulee kehittää niin, että epäsuotuisten geenien leviäminen ja
midbiotic-plasmidien erillinen leviäminen estetään. Myös geenisaksien
tehokkuutta alentavien mutaatioiden vaikutusta tulee vähentää. Vaihtoehtoisesti
ESBL-kantajuuden poistamiseksi voitaisiin käyttää bakteereita infektoivia ja
tappavia lyyttisiä faageja. Tässä väitöskirjassa osoitan, että tarvittaessa faageja
voidaan eristää ympäristöstä ESBL-infektioihin liitetyille enterobakteereille ja
valmistaa yksilöllinen faagikoktaili faagiterapiaa varten.
YSO-asiasanat: enterobakteerit; antibioottiresistenssi; horisontaalinen geeninsiirto; plasmidit; bakteriofagit; fagiterapia; geenitekniikka
Vapaat asiasanat: antibiotic resistance; horizontal gene transfer; conjugative plasmids; bacteriophages; phage therapy; CRISPR-Cas9
Liittyvät organisaatiot
OKM-raportointi: Kyllä
Raportointivuosi: 2019
