A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
DNA recovery from Droplet Digital™ PCR emulsions using liquid nitrogen (2020)


Dutra, L., Franz, O., Puupponen, V.-M., & Tiirola, M. (2020). DNA recovery from Droplet Digital™ PCR emulsions using liquid nitrogen. Biotechniques, 69(9), 451-454. https://doi.org/10.2144/btn-2020-0076


JYU-tekijät tai -toimittajat


Julkaisun tiedot

Julkaisun kaikki tekijät tai toimittajat: Dutra, Lara; Franz, Ole; Puupponen, Veli-Mikko; Tiirola, Marja

Lehti tai sarja: Biotechniques

ISSN: 0736-6205

eISSN: 1940-9818

Julkaisuvuosi: 2020

Ilmestymispäivä: 26.10.2020

Volyymi: 69

Lehden numero: 9

Artikkelin sivunumerot: 451-454

Kustantaja: Future Science Ltd

Julkaisumaa: Britannia

Julkaisun kieli: englanti

DOI: https://doi.org/10.2144/btn-2020-0076

Julkaisun avoin saatavuus: Avoimesti saatavilla

Julkaisukanavan avoin saatavuus: Kokonaan avoin julkaisukanava

Julkaisu on rinnakkaistallennettu (JYX): https://jyx.jyu.fi/handle/123456789/72402


Tiivistelmä

Droplet microfluidics is a technology that enables the production and manipulation of small volumes. In biosciences, the most popular application of this technology is Droplet Digital™ PCR (ddPCR™), where parallel nanoliter-scale PCR assays are used to provide a high sensitivity and specificity for DNA detection. However, the recovery of PCR products for downstream applications such as sequencing can be challenging due to the droplets' stability. Here we compared five methods for disrupting the droplets to recover DNA. We found that rapid freezing in liquid nitrogen results in a clear phase separation and recovery of up to 70% of the DNA content. Liquid nitrogen freezing can thus offer a simple and environmentally friendly protocol for recovering DNA from ddPCR.


YSO-asiasanat: biotekniikka; laboratoriotekniikka; mikrofluidistiikka; DNA

Vapaat asiasanat: amplicon recovery; breaking droplets; Droplet Digital™ PCR (ddPCR™); droplet microfluidics; emulsion PCR


Liittyvät organisaatiot


Hankkeet, joissa julkaisu on tehty


OKM-raportointi: Kyllä

Raportointivuosi: 2020

JUFO-taso: 1


Viimeisin päivitys 2022-20-09 klo 15:30