Rasvamaksan biomarkkeriaineisto hankkeesta Personoitu ravitsemusinterventio rasvamaksan hoitamiseksi


Pekkala, Satu; Hintikka, Jukka; Mäkinen, Elina; Lensu, Sanna; Lehtonen, Marko; Keski-Rahkonen, Pekka; O'Connell, Thomas; Juvonen, Risto; Kuula, Juho; Hakkarainen, Antti; Laukkanen, Jari et al. (2023). Liver fat biomarkers study from the 'Personalized diet intervention to treat fatty liver' project. University of Jyväskylä. https://doi.org/10.17011/jyx/dataset/85068.


JYU-tekijät: 
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): Kyllä
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): Ei
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): Ei
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): Ei

Kaikki tekijät: Pekkala, Satu; Hintikka, Jukka; Mäkinen, Elina; Lensu, Sanna; Lehtonen, Marko; Keski-Rahkonen, Pekka; O'Connell, Thomas; Juvonen, Risto; Kuula, Juho; Hakkarainen, Antti; Laukkanen, Jari; Pietiläinen, Kirsi

Rahoittajat: Suomen Akatemia; Suomen Kulttuurirahasto

Oikeudenhaltijat: 

Muut tutkimuksen toteuttamiseen osallistuneet: 


Saatavuus ja tunnisteet

Saatavuustieto: Ota yhteyttä omistajaan

Aineiston julkaisuvuosi: 2023

URN-tunniste alkuperäisessä julkaisupaikassa: http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-202301181370

DOI-tunniste alkuperäisessä julkaisupaikassa: https://doi.org/10.17011/jyx/dataset/85068

URN-tunniste JYXissä: http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-202301181370

DOI-tunniste JYXissä: https://doi.org/10.17011/jyx/dataset/85068


Aineiston kuvailu

Kuvaus: The study aimed at finding gut microbiota signatures and metabolite markers in plasma and feces related to high liver fat content in humans. Based on imaging, we divided study participants into low (<5%, LF, n=25) and high (>5%, HF, n=39) liver fat groups. Fecal (LF n=14, HF n=25) and plasma (LF n=11, HF n=7) metabolomes of subsets of participants were studied using liquid chromatography/high resolution mass spectrometry. The gut microbiota were analyzed using 16S rRNA gene sequencing. Additionally, blood clinical variables, body composition and diet were studied.

The list of metadata variables can be found below. They are categorized by the type of sample and/or analysis.

BLOOD CLINICAL VARIABLES & UNITS

alanine aminotransferase, ALT (U/L)
aspartate aminotransferase, AST (U/L)
gamma-glutamyltransferase, GGT(U/L)
total cholesterol (mmol/L)
high-density lipoprotein, HDL (mmol/L)
low-density lipoprotein, LDL (mmol/L)
triglycrides (mmol/L)
glucose (mmol/L)
insulin (iU/L)
HOMA-IR


BODY COMPOSITION VARIABLES & UNITS

Height (cm)
Weight (kg)
body mass index, BMI (kg/m2)
Waist circumference (cm)
blood pressure (BP) systolic (mm Hg)
blood pressure (BP) diastolic (mm Hg)
Liver fat %


GUT MICROBIOTA COMPOSITION

fastq files of the sequences
OUT counts per each sample
relative abundance per each sample
diversity measures (Shannon, Chao1, phylogenetic diversity, Bray Curtis distance)


METABOLITES

plasma metabolites & identification information
fecal metabolites & identification information


DIETARY INTAKES & UNITS (from 3 different days & average from 3 days)

Energy (kJ)
Energy (kcal)
Protein (g)
Carbohydrates (g)
Fat (g)
Alcohol
Coffee (dl/3 days) *
Fatty acids (g)
Monosaturated Fatty acids (g)
Polyunsaturated Fatty acids (g)
Sucrose (g)
Fiber, total (g)
Vitamin C (mg)
Thiamine (B1) (mg)
Vitamin E (mg)
Vitamin A (µg)
Vitamin D (µg)
Riboflavin (B2) (mg)
Vitamin K (mg)
Vitamin B6 (mg)
Folate (B9) (µg)
Sodium (mg)
Magnesium (mg)
Calcium (mg)
Potassium (mg)
Iron (mg)
Iodine (µg)
Phosphorus (mg)
Selenium (µg)
Zinc (mg)
Fatty acids, total (g)
Cholesterol (mg)
Fatty acids, trans (g)
Lactose (g)
Fiber, total amount (g)
Vitamin B12 (cobalamine) (µg)
Salt (mg)
Omega-6 Fatty acids (g)
Omega-3 Fatty acids (g).

Aineiston kieli: englanti

Vapaat asiasanat: liver fat; gut microbiota; metabolites; biomarkers; clinical biochemistry; liver enzymes; body composition

YSO-asiasanat: rasvamaksa; mikrobiologia; insuliiniresistenssi; aineenvaihdunta

Tieteenalat : 319 Muut lääketieteet

Seurantakohteet: Liikuntalääketiede (Liikuntatieteellinen tiedekunta LTK, SPORT) LLT; Liikuntafysiologia (Liikuntatieteellinen tiedekunta LTK, SPORT) LFY

Käsitteletkö erityisiä henkilötietoryhmiä tutkimuksessasi?: Kyllä


Aineistoon liittyvät Converiksessa olevat hankkeet


Viimeisin päivitys 2024-04-04 klo 14:22