Sequencing dataset related to the influence of terrestrial plant litter input on microbial community composition and biomass in lake water


Vesamäki, Jussi; Rigaud, Cyril; Litmanen, Jaakko; Nissinen, Riitta; Taube, Robert; Taipale, Sami. (2023). Sequencing dataset related to the influence of terrestrial plant litter input on microbial community composition and biomass in lake water. University of Jyväskylä. https://doi.org/10.17011/jyx/dataset/86103.


JYU-tekijät: 
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): Kyllä
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): Kyllä
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): 
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): 
  • Yhteyshenkilö (kyllä/ei): 

Kaikki tekijät: Vesamäki, Jussi; Rigaud, Cyril; Litmanen, Jaakko; Nissinen, Riitta; Taube, Robert; Taipale, Sami

Rahoittajat: Suomen Akatemia

Oikeudenhaltijat: 


Saatavuus ja tunnisteet

Saatavuustieto: Ladattavissa verkosta

Aineiston julkaisuvuosi: 2023

URN-tunniste alkuperäisessä julkaisupaikassa: http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-202303232252

DOI-tunniste alkuperäisessä julkaisupaikassa: https://doi.org/10.17011/jyx/dataset/86103

URN-tunniste JYXissä: http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-202303232252

DOI-tunniste JYXissä: https://doi.org/10.17011/jyx/dataset/86103


Aineiston kuvailu

Kuvaus: We compared decomposition processes of three deciduous tree leaves (Alnus sp., Betula sp., and Populus tremula) in lake water together and without lake water microbiome, which was killed by autoclaving to separately examine the microbial community succession and decomposition process without the effect of lake water microbiome. We followed microbial activity and community succession during the first three weeks and quantified microbial biomass and the proportion of fungal versus bacterial decomposers by sterol and phospholipid fatty acid (PLFA) analyses.

The present dataset contains the raw sequencing files that were used to identify the microbial and fungal communities of the samples collected during the study.

Aineiston kieli: englanti

Vapaat asiasanat: litter decomposition, microbial biomass, allochthonous, size exclusive chromatography, carbon cycling

YSO-asiasanat: järvet; lehdet (kasvinosat); mikrobiekologia

Seurantakohteet: Ekologia ja evoluutiobiologia (Bio- ja ympäristötieteiden laitos BIOENV) EKO; Akvaattiset tieteet (Bio- ja ympäristötieteiden laitos BIOENV) WET

Käsitteletkö erityisiä henkilötietoryhmiä tutkimuksessasi?: Ei


Aineistoon liittyvät Converiksessa olevat hankkeet


Viimeisin päivitys 2024-07-05 klo 11:28